健全的財政是推動市政建設最有力的後盾，台南市升格之初，因當時中央政府重北輕南，資源分配不公，財政收支劃分未能合理分配影響，加上承接前台南縣(573億)、台南市(401億)共974億元債務，以及鄉鎮公所33億元債務，總債務達1007億元，債務龐大，甚至曾在媒體調查「財政昏迷指數」時，被歸列為中重度昏迷的「插管區」，情況嚴峻。
但時任市長的賴院長勉勵行政團隊，沒有悲觀的權利，要勇於面對現實、努力解決問題，「而不是只會哭窮、只會要糖吃」；透過節流及開源，一定要逐步健全財政。
在節流方面，包括嚴守財政紀律以「零基預算」的精神籌編每一年度的總預算。確認施政優先順序，移緩濟急，撙節支出以投入重大民生建設。全面檢討組織與員額結構的合理性，嚴格管控預算員額。擴大集中支付規模，靈活財務調度，節省債息支出。.
在開源方面，則引進民間資源參與投資，運用民間自提方式，讓投資更具效率，例如安南醫院、臺南都會公園博物館園區、林百貨等促參案件陸續簽約。利用公辦市地重劃，加速土地的活化使用。持續進行閒置及低度利用財產活化再利用，創造無形資產，減輕市府財政負擔。以及合理調整公告現值、公告地價，未來繼續朝向房屋標準單價、地段率等稅基之合理調整，提升自有財源。
感謝全體同仁上下一心、財主嚴格把關、稅務局努力清查追繳、及地方發展帶動稅收的增益，我們逐年降低負債比例；104年度編列預算時，歲出因需容納許多重大建設，其差短約50幾億元，需編列舉債支應，但在撙節開支下，到了年底，歲入歲出16年來首次由短絀轉為賸餘20.81億餘元，105年度及106年度總決算歲入歲出也持續賸餘，創下連續3年賸餘的好成績。在107年總預算，我們更創下零舉債就達到歲入歲出平衡的目標；截至107年5月，我們更已經償還221億元債務，將總債務縮小到只剩下786億，創下歷任縣市長未能達到的成績，也對子孫更有交代。
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